在过滤菌种时，选择合适的滤芯是至关重要的。由于菌种可能包括细菌、真菌、病毒等多种微生物，且它们的大小、形态和特性各不相同，因此需要根据具体的过滤需求和菌种特性来选择滤芯。一般选择需要考虑：

1. 考虑孔径大小

孔径选择：一般情况下，孔径在0.1微米以下的滤芯可以有效过滤细菌。因为细菌的大小一般在0.2至2微米之间，所以孔径越小的滤芯对细菌的过滤效果越好。对于需要过滤病毒等更小微粒的场合，可能需要选择孔径更小的滤芯，如超滤滤芯或纳滤滤芯。

2. 材质选择

抗菌材质：一些滤芯材质具有抗菌性能，如某些特殊处理的聚酯纤维滤芯，这些滤芯能有效抑制细菌、霉菌和真菌的生长，从而保持滤芯的清洁和过滤效果。

耐腐蚀材质：如果过滤介质中含有腐蚀性物质，需要选择耐腐蚀性能好的滤芯材质，如不锈钢、聚四氟乙烯（PTFE）等。

3. 过滤效率与寿命

过滤效率：滤芯的过滤效率越高，过滤出来的水质或空气质量也就越纯净。然而，过滤效率高的滤芯可能使用寿命相对较短，因此需要综合考虑过滤效率和滤芯寿命之间的平衡。

使用寿命：选择具有较长使用寿命的滤芯可以降低更换成本和维护频率。

4. 特定需求

病毒过滤：如果需要过滤病毒等更小的微粒，可能需要选择超滤滤芯或纳滤滤芯。这些滤芯具有更小的孔径和更高的过滤精度。

空气过滤：对于空气中的菌种过滤，可以选择具有高效颗粒空气（HEPA）过滤技术的滤芯。HEPA滤芯能够有效过滤空气中的细菌、病毒、花粉、尘螨等微小颗粒物。

5. 维护与清洁

易清洗性：选择易于清洗和维护的滤芯可以延长其使用寿命并降低维护成本。一些滤芯支持反冲洗或高温消毒等清洁方式。

6. 综合考虑

在选择滤芯时，需要综合考虑以上因素以及具体的过滤需求和预算。不同品牌、不同型号的滤芯在性能、价格和使用寿命等方面可能存在差异，因此需要进行综合比较和评估。

以上，对于过滤菌种来说，没有一种滤芯是绝对最好的选择，而是需要根据具体的过滤需求和菌种特性来选择最合适的滤芯。建议在选择时咨询专业人士或参考相关权威资料以获取更准确的建议。